سریال بله آقای وزیر ، مجموعه ای طنز گونه است که در آن یک وزارت‌خانه ساختگی به نام «وزارت امور اداری» که مانند همه وزارت‌خانه‌ها در دنیای واقعی باید شخصی به نام وزیر در رأس آن باشد را تصور کنید. این وزیر هم مانند همه وزراء معاون و منشی دارد و در جایگاه یک مسئول با طرحها و ایده‌های بلندپروازانه‌ای وارد کار می‌شود غافل از اینکه نظام اداری و کارمندانی که در این دستگاه جا خوش کرده‌اند همه نوع کاری می‌کنند تا بقای خود را تضمین کنند و در این راه در کسوتی ظاهر‌الصلاح و دلسوزانه به وزیر نزدیک می‌شوند اما آنچه که حاصل می‌شود نتیجه معکوسی بر جای می‌گذارد. کارمندان ارشد دستگاه و تشکیلات اداری حاضر نیستند به وزیر میدان دهند و از درآمدهای کلانی که به واسطه جایگاهشان به جیب می‌زنند چشم‌پوشی کنند. افکار وزیر و گرایشهای حزبی او به علاوه بلندپروازیهایش با منافع این کارمندان در تضاد قرار می‌گیرد و هر کسی می‌کوشد در این تنازع بقا پیروز میدان باشد.
بارون فرانکشتاین، جسد یک دختر جوان بنام کریستینا را به دست می آورد که فاقد هرگونه علائم حیاتی است. او یک نسخه از روح زن که اعدام شده را درون بدن یک مرد جوان قرار می دهد. با اینکه خاطرات مرد جوان هنوز باقی مانده و دست نخورده است...
جوانی سرکش که بعد از دستبرد زدن به یک نانوایی محکوم به گذراندن مدت زمانی در مرکز بازپروری شده، با اثبات تواناییهای خود در دو و میدانی خود را نشان می دهد. در زمانهای دویدن او به زندگی گذشته خود فکر کرده و تصمیم به بازنگری زندگی خود می گیرد...