در انیمیشن در جستجوی دوری ۲ ، نمو و مارلین که با دوری ، ماهی آبی رنگ فراموش کار به نام دوری آشنا شده بودند ، در کنار هم زندگی خوبی را تشکیل داده اند ولی دوری پس از رفتن به گردش کلاسی به همراه نمو برای دیدن عبور سفره ماهی ها به اقیانوس می روند ولی خستگی این گردش موجب اوج گرفتن فراموشی دوری می شود. دوری که حال خودش را هم نمی شناسد از کنار نمو و پدرش دور می شود و ماجراجویی اش را آغاز می کند. نمو و پدرش که حال با مشکل گم شدن دوری مواجه هستند سعی می کنند که بتوانند دوری را تا قبل از طولانی نشدن فراموشی اش پیدا کنند ولی …
این فیلم داستان زندگی یک سرباز آمریکایی به نام «جان کارتر» است که به شکلی تصادفی سر از سیاره مریخ در می آورد، و در آنجا جهانی باشکوه و قابل سکونت را پیدا می کند که موجوداتی به بلندی ۱۲ فوت در آن زندگی می کنند. پس از گریختن از چنگ این موجودات، کارتر با شاهزاده خانمی مواجه می شود که به دنبال یک ناجی برای سرزمین اش است...
صدها سال است که انسان ها کره ي زمين را به دليل آلودگي ترک کرده اند و روباتي به نام «والي» هم چنان به کار زباله جمع کردن مشغول است. تا اين که از طرف انسان ها روباتي به نام «ايو» به کره ي زمين فرستاده مي شود تا امکان بازگشت تمدن بشري به زمين را بررسي کند. خيلي زود «ايو» به نتيجه ي مورد نظر دست پيدا مي کند و پس از چندي به سفينه ي فضايي حامل انسان ها برگردانده مي شود. اما «والي» نيز که به «ايو» دل باخته به دنبال او به راه مي افتد...
یک دلقک ماهی به نام مارلین، در مورد پسرش نیمو زیادی حساس است. او پسرش را در اقیانوس گم می‌کند و در پی آن با کمک ماهی به نام دوری به جستجوی نیمو می‌پردازد. به تدریج و پس از یافتن نیمو او متوجه می‌شود که نباید آنقدر مته به خشخاش بگذارد.
در هرفصل، مورچه‌ها مجبورند تا برای حشرات بیگانه که قوی‌تر از آن‌ها هستند، آذوقه جمع کنند و بیشتر ذخیره‌ی خود را به آن‌ها بدهند.فلیک که مورچه‌ای جوان و ماجراجو است تصمیم می‌گیرد تا به جای دوری برود و کمک بیاورد تا مورچه‌ها بتوانند از پس این حشرات بربیایند...